第一、避免SiO2進入在線氣相色譜儀檢測器，色譜柱要很好的老化，特別硅氧烷類流動液，其液膜要薄。還要防止衍理化后樣品中有SiO2殘留進入色譜柱。
第二、關閉載氣（如換鋼瓶或換色譜柱）前，應將熱離子源的電壓調為0 ，否則沒有載氣通過，銣鹽珠會在幾分鐘內燒毀。
第三、在滿足靈敏度要求的條件下，盡可能用低的熱離子源電壓。
第四、儀器存放要避免潮濕，當儀器不用時，好保持檢測器溫度在100以上（熱離子源電壓要關閉）。
第五、如果一段時間不進樣分析（如過夜），就應該降低熱離子源電壓，但不要關閉。
由于減低電壓后銣鹽珠仍是熱的，再進樣時升高電壓很快就能穩固。假如開放后再回電壓，則在線氣相色譜儀需求幾小時的平衡時間。
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